生图功能边界

智能体可以根据数据文件或文字描述生成数据分析图和科研示意图。提交任务时，应明确数据含义、希望表达的结论、图像类型和输出要求；生成后仍需核对数值、统计方法、结构关系和文字标注。

可以生成哪些图像

数据分析图

场景	常见图像
基础统计与分布	柱状图、折线图、散点图、箱线图、小提琴图、直方图
统计检验	t 检验、方差分析和非参数检验结果的显著性标记图
转录组与其他组学	PCA 图、火山图、热图、富集气泡图、MA 图
单细胞分析	UMAP、t-SNE、DotPlot、FeaturePlot
微生物组分析	Alpha/Beta 多样性图、PCoA、物种组成堆叠图、桑基图
基因组分析	突变瀑布图、Circos 图、基因结构图、基因组浏览器轨道图

图中数值、误差线、分组、显著性标记和筛选阈值依赖输入数据与分析方法。用于正式报告时，不要只要求“画一张火山图”或“比较两组差异”，还应说明统计方法和图中需要保留的信息。

科研示意图

智能体也可以根据文字说明整理和绘制以下图像：

• 信号通路、基因调控和药物作用机制图。
• 细胞环境、器官剖面和抗体结合等科研示意图。
• 蛋白结构、结合口袋、配体相互作用和表面电势图。
• 二维分子结构、官能团标注和反应路线等化学图。

复杂示意图适合用来整理机制关系和形成初稿，但不应代替专业数据库、结构绘图软件或人工科学审校。蛋白三维结构的交互调整、测量和导出方法，请参阅PyMOL 蛋白结构可视化。

提交生图任务

使用自己的数据

1. 在智能体工作台中发起新对话。
2. 选择附件按钮，上传包含数据的表格或其他支持文件。
3. 在问题中逐一说明文件、工作表和字段的含义。
4. 写明图像类型、分组方式、统计方法、配色、标注和输出格式。
5. 发送任务，等待智能体完成数据处理并返回结果。
6. 下载图像和相关结果文件，核对数据、图例、坐标轴与统计结论。

上传文件的具体方法参阅输入问题与上传文件。

没有原始数据时

智能体可以根据文字说明制作版式草图或使用模拟数据演示图形，但模拟数据不能作为研究结果。需要表达真实实验结果时，应上传真实数据或提供可核对的数据来源。

只使用文字描述

绘制机制图或科研示意图时，可以在问题中列出需要出现的对象、对象之间的关系和希望强调的结论。关系复杂时，建议先让智能体返回节点与连线清单，确认内容后再生成图像。

例如：

绘制一张 EGFR 信号通路及药物抑制机制示意图。左侧展示配体结合后 EGFR 二聚化和下游 RAS–RAF–MEK–ERK、PI3K–AKT–mTOR 通路，右侧展示药物抑制后的信号减弱。请使用白色背景、横向布局和色盲友好配色；所有节点使用中英文对照，并在生成前先列出节点和连接关系供我确认。

把要求写清楚

一个便于执行的生图需求通常包含：

数据或研究对象 + 图像类型 + 分组与比较方式 + 统计方法
+ 必须展示的字段 + 布局与配色 + 文字与标注 + 输出格式

数据分析图示例

使用附件 expression.csv 绘制差异表达火山图。gene_id 是基因编号，log2FC 是倍数变化，padj 是校正后的 P 值。以 |log2FC| ≥ 1 且 padj < 0.05 标记显著基因，上调为红色、下调为蓝色、其他为灰色；标注 padj 最小的 10 个基因。输出 300 dpi PNG，并同时返回用于绘图的数据表和脚本。

机制图示例

根据附件中的机制说明绘制横向信号通路图。必须包含受体、细胞膜、两条下游通路、药物作用位点和最终表型；激活使用实线箭头，抑制使用 T 形线。不要补充附件中没有依据的关系。先返回节点和连接关系清单，确认后再出图。

提交前检查

• 数据文件、工作表、字段和单位是否说明清楚。
• 分组顺序、对照组和样本量是否正确。
• 统计方法、多重检验校正和显著性阈值是否明确。
• 坐标轴、误差线、图例和标签是否有具体要求。
• 是否需要返回绘图脚本、处理后的数据或可编辑文件。
• 图片尺寸、分辨率、背景和文件格式是否明确。

核对生成结果

数据分析图

至少检查以下内容：

• 图中样本数、分组和数值范围是否与输入文件一致。
• 坐标轴名称、单位、刻度和图例是否正确。
• 均值、中位数、误差线和显著性标记是否使用了预期方法。
• 缺失值、异常值和重复记录是否得到合理处理。
• 聚类、降维、富集分析或差异分析的参数是否在结果中说明。

如果图像与数据不一致，应要求智能体读取原文件重新计算，而不是直接修改图片上的数值。

科研示意图

逐项核对：

• 分子、蛋白、基因和药物名称是否正确。
• 激活、抑制、结合、转运和定位关系是否画反。
• 通路方向、细胞区室和结构位置是否符合资料来源。
• 图中的文字、缩写、图例和颜色含义是否一致。
• 是否出现问题中没有提供、且没有可靠依据的关系。

化学图和复杂科研示意图

二维化学结构、反应路线、复杂细胞场景以及包含大量文字的示意图更容易出现键型、原子、空间关系或文字错误。生成结果可作为构图初稿，但在论文、专利、汇报或实验决策中使用前，必须通过专业软件和可靠资料逐项复核。

常见问题

现象	建议处理
图形类型不符合预期	指定图形名称，并说明横轴、纵轴、分组和每个视觉元素代表什么
数值或样本数不正确	要求重新读取原始文件，列出参与绘图的记录数和数据处理步骤
显著性标记不正确	明确检验方法、配对关系、多重检验校正方法和阈值
图中文字过多或出现错字	减少图内文字，使用编号配合图注，或分成多个面板生成
机制关系不准确	先生成节点与连线清单，核对后再绘图
图片难以继续修改	在问题中要求同时返回绘图脚本、数据表或可编辑格式
一次生成的内容过于拥挤	拆成多个子图，并说明每个面板只回答一个问题